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大型長讀長RNA測序數(shù)據(jù)集發(fā)布

2025-04-30 16:53 來源:科技日?qǐng)?bào)
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(責(zé)任編輯:韓璐)
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大型長讀長RNA測序數(shù)據(jù)集發(fā)布

2025年04月30日 16:53   來源:科技日?qǐng)?bào)   

  科技日?qǐng)?bào)北京4月29日電 (記者張夢(mèng)然)由新加坡科技研究局基因組研究所領(lǐng)導(dǎo)的科學(xué)家團(tuán)隊(duì),發(fā)布了迄今全球最大、最全面的長讀長RNA測序數(shù)據(jù)集之一——新加坡納米孔表達(dá)數(shù)據(jù)集(SG-NEx)。這一成果有望解決疾病研究中長期存在的技術(shù)瓶頸,使研究人員能夠更精確地解析RNA的復(fù)雜結(jié)構(gòu),為制定下一代精準(zhǔn)診斷和治療策略奠定了堅(jiān)實(shí)基礎(chǔ)。相關(guān)研究發(fā)表在最新一期《自然·方法學(xué)》期刊上。

  短讀長RNA測序是現(xiàn)代轉(zhuǎn)錄組學(xué)的核心工具,但其局限性日益顯現(xiàn)。它通常無法完整捕獲全長RNA分子以及諸如剪接異構(gòu)體、融合轉(zhuǎn)錄本等復(fù)雜變異,也無法識(shí)別影響疾病進(jìn)展(如癌癥)的關(guān)鍵RNA化學(xué)修飾。這些缺陷限制了其在發(fā)現(xiàn)臨床相關(guān)生物標(biāo)志物方面的應(yīng)用潛力。

  相比之下,SG-NEx采用的是長讀長RNA測序技術(shù),能夠直接讀取完整的RNA分子,從而揭示更深層次的生物學(xué)信息,并顯著減少分析盲區(qū)。這種能力對(duì)于發(fā)現(xiàn)新的生物標(biāo)志物和開發(fā)更精確的治療方法至關(guān)重要。

  為了形象理解,可以將RNA比作一本書:短讀長測序就像將書頁撕成碎片后嘗試重建內(nèi)容,容易遺漏細(xì)節(jié)且容易出錯(cuò);而長讀長測序則像是閱讀整頁甚至整章,使關(guān)鍵信息特別是那些隱藏在與疾病相關(guān)的復(fù)雜RNA結(jié)構(gòu)中的細(xì)節(jié)得以清晰呈現(xiàn)。

  為最大化該數(shù)據(jù)集的影響力,SG-NEx項(xiàng)目采取快速公開發(fā)布數(shù)據(jù)策略,允許世界各地的研究者基于這些高質(zhì)量數(shù)據(jù)開發(fā)并驗(yàn)證新的RNA分析方法。這被認(rèn)為是推動(dòng)生物醫(yī)學(xué)發(fā)現(xiàn)、釋放長讀長測序潛力、改善疾病診斷和患者護(hù)理的重要一步。

  目前,團(tuán)隊(duì)正進(jìn)一步推進(jìn)項(xiàng)目發(fā)展,計(jì)劃開發(fā)用于自動(dòng)化RNA特征識(shí)別的人工智能工具、擴(kuò)大全球數(shù)據(jù)共享范圍,并推動(dòng)長讀長測序方案的標(biāo)準(zhǔn)化。這些舉措將為長讀長RNA測序技術(shù)在臨床中的廣泛應(yīng)用提供重要支撐。


(責(zé)任編輯 :韓璐)

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